El Centro tiene como órgano de gobierno una Dirección constituida por un/a director/a y la Comisión Directiva.
La Comisión Directiva se elige a través de una votación de todos los investigadores del Centro, excepto los asociados, en que se eligen cinco miembros (y un suplente).
La Comisión Directiva está integrada por:
Tres investigadores principales de proyectos, siendo al menos uno de ellos investigador responsable de línea.
Dos investigadores de posgrado.
Dos suplentes por cada categoría.
Actualmente la Comisión Directiva está integrada por:
Roberto Aguirre - Director
Victoria Gradín - Subdirectora
Alejandra Carboni - Investigador principal
Camila Zugarramurdi - Investigador de posgrado
Anaclara Gerosa - Investigador de posgrado
Juan Valle Lisboa - Primer suplente Investigador principal
Ignacio Cervieri - Segundo suplente Investigador principal
Mauricio Castillo - Suplente de Investigador de posgrado
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